DM840: Algoritmer i kemoinformatik (10 ECTS)
STADS: 15018101Niveau
Kandidatkursus
Undervisningsperiode
Kurset er placeret i efterårssemesteret.
Ansvarlige undervisere
Email: daniel@imada.sdu.dkSkemaoplysninger
| Hold | Type | Dag | Tidsrum | Lokale | Uger | Kommentar |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Fælles | I | Mandag | 14-16 | IMADA semi | 18 | |
| Fælles | I | Mandag | 12-14 | IMADA semi | 19 | |
| Fælles | I | Tirsdag | 08-10 | IMADA semi | 16 | |
| Fælles | I | Onsdag | 10-12 | IMADA semi | 5-6,10-11,13,16,18-20 | |
| Fælles | I | Onsdag | 10-12 | U142 | 14 | |
| Fælles | I | Onsdag | 10-12 | U147 | 15 | DM840 |
| Fælles | I | Torsdag | 16-18 | IMADA semi | 5,10,13,16-17,19-20 | |
| Fælles | I | Torsdag | 16-18 | U14 | 6,9,11,14 | |
| Fælles | I | Torsdag | 16-18 | U10 | 15 | DM840 DM |
| Fælles | I | Fredag | 08-10 | IMADA semi | 5-6,10-11,13,17-18,20-21 | |
| Fælles | I | Fredag | 08-10 | U10 | 9 | DM |
| Fælles | I | Fredag | 08-10 | U142 | 14 | |
| Fælles | I | Fredag | 08-10 | U11 | 15 | DM840 DM |
Vis personligt skema for dette kursus.
Kommentar:
Ubegrænset deltagerantal.
Indgangskrav:
Ingen
Faglige forudsætninger:
DM553 Kompleksitet og beregnelighed og DM554 Lineær og heltalsprogrammering (tidl. DM515) anbefales at være kendt.
Kursusintroduktion
Kemoinformatik er et forskningsområde, der
kombinerer metoder fra datalogi og kemi med henblik på at løse kemiske problemer effektivt. Kurset vil give den nødvendige teoretiske
baggrund og algoritmer for at løse sådanne problemer. Deltagerne vil
lære at anvende disse metoder, med henblik på at undersøge komplekse
interaktioner i kemiske og biologiske systemer, og på at opdage nye
egenskaber der frekommer som følge af den systemiske synsvinkel.
Forventet læringsudbytte
Ved kursets afslutning forventes den studerende at kunne:
- anvende og forklare metoder, modeller og algoritmiske ideer dækket i kurset,
- formulere ovenstående i præcist sprog og notation,
- implementere algoritmer og datastrukturer fra kurset,
- beskrive implementeringen og det eksperimentelle arbejde i et klart og præcist sprog, og på en struktureret måde.
- repræsentation af molekylære strukturer
- struktur deskriptorer
- grafisomorfiproblemer
- kombinatoriske strukturer
- Pólyas tælleteori
- kunstige kemier (artificial chemistries)
- graf-grammatikker
- støkiometriske modeller
- metaboliske netværk og stofskifteveje
- flux balance analyse
- organisationsteori
- Petri nets
- Meddeles ved kursets start.
Kursets hjemmeside
Dette kursus benytter e-learn (blackboard).
Forudsætningsprøver
Obligatoriske opgaver. Bedømmes med bestået/ikke bestået, intern
bedømmelse ved underviser. (15018112)
Eksamen- og censurform:
- Mundtlig eksamen. Bedømmes efter 7-trinsskalaen, ekstern censur (10 ECTS). (15018102)
På naturvidenskab er undervisningen tilrettelagt efter trefasemodellen dvs. intro, trænings- og studiefasen.
Introfase: 42 timer
Træningsfase: 28 timer, heraf:
- Eksaminatorie: 28 timer
Aktiviteter i studiefasen
Sprog
Dette kursus undervises på dansk eller engelsk, afhængigt af underviseren. Dog altid på Engelsk ved deltagelse af internationale studerende.
Kursustilmelding
Se tilmeldingsfrister.
Pris for åben uddannelse
Se priser for enkeltkurser.
Denne kursusbeskrivelse var gyldig fra 1. februar 2016 til 31. januar 2017.
